合作成果
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Cell：基因组数据资源揭示蛇类起源和独特的遗传机制Cell：基因组数据资源揭示蛇类起源和独特的遗传机制蛇是一种非凡的鳞片动物，具有独特的形态适应性，特别是与脊椎动物骨骼、器官和感觉系统的进化有关。为了阐明蛇表型的遗传基础，文章收集并分析了来自12个蛇科的14个新基因组。文章基于比较基因组学，通过功能实验研究了蛇形态特征的遗传基础，发现部分基因、调节元件和结构变异可能有助于蛇肢体缺失、细长的身体计划、不对称的肺部、感觉系统和消化适应的进化。文章确定了一些基因和调节元件，这些基因和调节元素可能影响了盲蛇的视觉进化、骨骼系统和饮食，以及红外敏感蛇的体温接收。文章的研究为蛇和脊椎动物的进化和发展提供了见...
2023-07-06 | 合作成果
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Nature Genetics：燕麦参考基因组构建及其揭示的六倍体栽培燕麦的起源与进化Nature Genetics：燕麦参考基因组构建及其揭示的六倍体栽培燕麦的起源与进化燕麦作为谷物中最好的全价营养食品，因其富含蛋白质、不饱和脂肪酸以及可溶性膳食纤维而广受消费者青睐。同时，栽培燕麦是六倍体作物，它在生物量、活力和对环境变化的适应性方面均具有多倍体植物的显著优势，在应对粮食安全挑战中可以发挥其独特作用。...
2022-07-18 | 合作成果
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PNAS：“飞蛙”滑翔的遗传机制PNAS：“飞蛙”滑翔的遗传机制动物复杂性状是动物长期适应演化的结果，是动物多样性形成的重要基础。自然界物种采取各种各样的进化策略以适应不同的栖息地，如高原、海洋、荒漠等。部分类群通过演化出了特殊的表型以适应树栖生活。树栖生活拓展了这些物种对垂直空间资源的利用，有助于它们躲避天敌，获取丰富的食物资源等。但森林环境复杂的立体结构也对动物的运动能力提出了严苛的要求。在白垩纪末期大规模物种灭绝事件后，无尾目多个科的物种独立演化出了攀爬和滑翔的相关表型，并成功拓殖树栖生态位，黑蹼树蛙就是其中的代表性物种。黑蹼树蛙隶属于树蛙科，常年生活...
2022-03-14 | 合作成果
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首个人工合成小麦衍生品种高质量基因组的组装发布（川麦104）首个人工合成小麦衍生品种高质量基因组的组装发布（川麦104）随着全球人口的日益增长和粮食需求的不断上升，提升小麦产量和品质已成为农业科研的重要课题。利用四倍体小麦和节节麦合成的人工合成小麦（SHWs），在小麦育种利用中能将野生亲本的优异基因转移到普通小麦中...随着全球人口的日益增长和粮食需求的不断上升，提升小麦产量和品质已成为农业科研的重要课题。利用四倍体小麦和节节麦合成的人工合成小麦（SHWs），在小麦育种利用中能将野生亲本的优异基因转移到普通小麦中...随着全球人口的日益增长和粮食需求的不断上升，提升小麦产量和品质已成为农业科研的重要课题。利用四倍...
2024-06-22 | 合作成果
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家蚕假基因的时空表达谱为其生物学作用提供了有价值的见解家蚕假基因的时空表达谱为其生物学作用提供了有价值的见解假基因是失去转录RNA分子或编码截短但可能具有功能的蛋白质的能力的序列。虽然它们曾经被认为是进化的无意义残余，但最近的研究表明，假基因在各种生物过程中发挥着重要作用。然而，对蚕（一种重要的模式生物）的假基因的研究是有限的，并且只集中在单个或几个特定的基因上。为了填补这些空白，我们对家蚕的假基因进行了系统的全基因组研究。我们使用来自蚕及其相关物种的蚕基因组组装、转录组、蛋白质序列鉴定了蚕中的假基因。然后，我们使用来自832个RNA-seq分析的转录组数据集来构建这些假基因的时空表达谱。此外，我们还...
2024-06-14 | 合作成果
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家蚕小型开放阅读框（smORFs）的系统鉴定和研究家蚕小型开放阅读框（smORFs）的系统鉴定和研究家蚕（Bombyxmori）不仅是一种优良的模式种，也是一种重要的农业经济昆虫。考虑到其维护成本低、无生物危害风险的优点，将其作为研究对象。小型开放阅读框（smORF）是一类重要的基因组元件，可以产生生物活性肽。然而，对家蚕中的smORF的鉴定和研究却很少。为了进一步研究家蚕的smORF，系统的全基因组鉴定是必不可少的。在这里，我们使用综合方法鉴定和分析了家蚕中的smORF。我们的结果表明，在家蚕中发现了至少738个高度可靠的smORF，34401个可能的smORFs得到了部分证据支持。我们还鉴...
2023-01-23 | 合作成果
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